本府深水苗圃建立於民國65年，於82年因配合高應大燕巢校區之設立，爰遷至燕巢區旗楠公路旁的深水里，緊鄰國立高雄師範大學及高雄應用科技大學燕巢校區，總面積56公頃，主要苗區4公頃

• 配合中央造林政策進行多年生適生於南部地區之喬木及灌木等苗木培育、撫育及馴化，提供本市公私有林之造林所需。
• 長期以來對本市之造林綠化、生態環境、水源函養、淨化空氣及國土保安等公益功能，達成相當顯著之績效，本苗圃發揮極大功能。